关于实验室

主要关注早期妊娠过程中子宫内膜蜕膜化、分娩启动及其异常的分子机制。妊娠是一个复杂的、受多维因素精确调控的过程,在胚胎与母体子宫相互作用过程中仍存在很多悬而未决的谜团,如何从不同的方向和维度来厘清这一过程是我们现在所面临的艰巨挑战,本课题组以生物信息为主要手段,利用空间转录组、单细胞RNA-Seq、单细胞表观组、RNA-Seq、Cut&Tag等前沿技术,结合多种转基因动物模型挖掘上述生理过程中的分子调控机制。

PI介绍

邓文波教授
邓文波
教授/博导
国家优青基金获得者
厦门大学南强青年拔尖A类人才
福建省高层次B类引进人才
厦门市"双百计划"高层次创新人才

妊娠是一个受多维因素精确调控的过程,在胚胎与母体子宫的相互作用过程中仍存在很多悬而未决的谜团,如何从不同的方向和维度来厘清这一过程是我们现在所面临的挑战。妊娠成功的母体如何在正确的时间起始分娩及其背后的分子机制现在也尚不明确,由于分娩起始异常可导致早产或者难产,课题组以生物信息为主要手段,在海量高通量数据中,结合多种转基因动物模型挖掘上述生理过程中蕴含的分子调控机制。现主持自然科学基金重点项目、优秀青年项目、面上项目和青年基金等多项基金,同时参与了多项国家重点研发计划,相关研究成果发表于J Clin Invest、Nat Communication、PNAS、Elife、Cell reports、Cell Death Diff等杂志。

工作经历

  • 2021.11 - 至今 厦门大学医学院 教授
  • 2019.3 - 2021.11 厦门大学医学院 副教授
  • 2014.10 - 2019.3 美国辛辛那提儿童医院医学中心 博士后
  • 2008.9 - 2013.10 厦门大学 博士
  • 2005.9 - 2008.7 东北农业大学 硕士
  • 2001.9 - 2005.7 东北农业大学 本科

主持课题

  • 国家自然科学基金重点项目,2025/01-2029/12,主持。
  • 国家优秀青年基金获得者,2022/01-2024/12,主持。
  • 国家自然科学基金面上项目,2022/01-2025/12,主持。
  • 国家自然科学基金面上项目,2020/01-2023/12,主持。
  • 厦门大学校长基金(成长基金),2019/01-2021/12,主持。
  • 国家自然科学基金青年基金项目,2018/01-2020/12,主持。

代表性成果

  1. Yang Liu #, Yang Wang #, Leilei Zhang #, Yedong Tang #, Yetao Hong, Meng Liu, Mengyuan Wang, Ya Sun, Xiaoyue Shen, Jie Mei, Min Wu, Na Kong, Shuangbo Kong, Haili Bao, Wenbo Deng, Guijun Yan, Haibin Wang, Haixiang Sun.
    Decrypting spatiotemporal code of human endometrial receptivity.
    Nat Commun, 2025.
  2. Deng N, Li G, Zhang L, Wang P, Liu M, He B, Tang Y, Cai H, Lu J, Wang H, Deng W#, Bao H#, Kong S#.
    H3K27me3 timely dictates uterine epithelial transcriptome remodeling and thus transformation essential for normal embryo implantation.
    Cell Death Differ, 2024.
  3. Jin B, Ding X, Dai J, Peng C, Zhu C, Wei Q, Chen X, Qiang R, Ding X, Du H, Deng W#, Yang X#.
    Deciphering decidual deficiencies in recurrent spontaneous abortion and the therapeutic potential of mesenchymal stem cells at single-cell resolution.
    Stem Cell Res Ther, 2024.
  4. Bao H, Sun Y, Deng N, Zhang L, Jia Y, Li G, Gao Y, Li X, Tang Y, Cai H, Lu J, Wang H#, Deng W#, Kong S#.
    PR-SET7 epigenetically restrains uterine interferon response and cell death governing proper postnatal stromal development.
    Nat Commun, 2024.
  5. Liu M*, Ji MJ*, Cheng JH, Li Y, Tian YP, Zhao H, Wang Y, Zhu S, Zhang LL, Xu XM, Feng GS, Liang XH, Bao HL, Tang YD, Kong SB, Lu JH, Wang HB#, Lu ZX# and Deng WB#.
    Deciphering an critical role of uterine epithelial SHP2 in parturition initiation at single cell resolution.
    Nat Commun, 2023.
  6. Zhao H*, Wang Y*, Xu H*, Liu M, Xu X, Zhu S, Liu Z, Cai H, Wang Y, Lu J, Yang X, Kong S, Bao H#, Wang H#, Deng W#.
    Stromal cells-specific retinoic acid determines parturition timing at single-cell and spatial-temporal resolution.
    iScience, 2023.
  7. Liu M*, Deng W*, Tang L, Liu M, Bao H, Guo C, Zhang, Lu J, Wang H*, Lu Z*, Kong S*.
    Menin directs regionalized decidual transformation through epigenetically setting PTX3 as an obstacle balancing FGF and BMP signaling.
    Nat Commun, 2022.
  8. Huang P, Deng W*, Bao H, Lin Z, Liu M, Wu J, Zhou X, Qiao M, Yang Y, Cai H, Rao F, Chen J, Chen D, Lu J, Wang H, Qin A, Kong S.
    SOX4 facilitates PGR protein stability and FOXO1 expression conducive for human endometrial decidualization.
    Elife, 2022.
  9. Lv H, Zhao G, Jiang P, Wang H, Wang Z, Yao S, Zhou Z, Wang L, Liu D, Deng W#, Dai J,# Hu Y#.
    Deciphering the endometrial niche of human thin endometrium at single-cell resolution.
    Proc Natl Acad Sci U S A, 2022.
  10. Du L*, Deng W*, Zeng S, Xu P, Huang L, Liang Y, Wang Y, Xu H, Tang J, Bi S, Zhang L, Li Y, Ren L, Lin L, Deng W, Liu M, Chen J, Wang H, Chen D.
    Single-cell transcriptome analysis reveals defective decidua stromal niche attributes to recurrent spontaneous abortion.
    Cell Prolif, 2021.
  11. Deng WB*, Yuan J*, Cha JY, Sun XF, Bartos A, Yagita H, Hirota Y, Dey SK.
    Endothelial cells in the decidual bed are potential therapeutic targets for preterm birth prevention.
    Cell Reports, 2019.
  12. Jia Yuan*, Shizu Aikawa*, Wenbo Deng*, Amanda Bartos, Gerd Walz, Florian Grahammer, Tobias B Huber, Xiaofei Sun, Sudhansu K Dey.
    Primary Decidual Zone Formation Requires Scribble for Pregnancy Success in Mice.
    Nat Commun, 2019.
  13. Shizu Aikawa*, Wenbo Deng*, Xiaohuan Liang, Jia Yuan, Amanda Bartos, Xiaofei Sun, Sudhansu K Dey.
    Uterine Deficiency of High-Mobility Group box-1 (HMGB1) Protein Causes Implantation Defects and Adverse Pregnancy Outcomes.
    Cell Death Differ, 2019.
  14. Wei Lei, Tingting Feng, Xing Fang, You Yu, Junjie Yang, Zhen-Ao Zhao, Junwei Liu, Wenbo Deng#, Shijun Hu#.
    Signature of circular RNAs in human induced pluripotent stem cells and derived cardiomyocytes.
    Stem Cell Res Ther, 2018.
  15. Yuan J*, Wenbo Deng*, Cha J, Xiaofei Sun, Jean-Paul Borg, Dey SK.
    Tridimensional visualization reveals direct communication between the embryo and glands critical for implantation.
    Nat Commun, 2018.
  16. Deng WB*, Cha J*, Yuan J, Haraguchi H, Bartos A, Leishman E, Viollet B, Bradshaw HB, Hirota Y, Dey SK.
    p53 coordinates decidual sestrin 2/AMPK/mTORC1 signaling to govern parturition timing.
    J Clin Invest, 2016.
  17. Deng WB, Liang XH, Liu JL, Yang ZM.
    Regulation and function of deiodinases during decidualization in female mice.
    Endocrinology, 2014.
  18. Deng WB, Tian Z, Liang XH, Wang BC, Yang F, Yang ZM.
    Progesterone regulation of Na/K-ATPase β1 subunit expression in the mouse uterus during the peri-implantation period.
    Theriogenology, 2013. (F1000Prime Recommended).

课题介绍

破译人类子宫内膜容受性的时空密码
破译人类子宫内膜容受性的时空密码

1.构建了人子宫内膜容受性建立过程的单细胞时空图谱

2.揭示胆固醇代谢与纤毛发生、以及 FGFs–FGFR2 介导的基质–上皮互作在容受性起始中的重要作用

上皮细胞SHP2在分娩启动过程中发挥关键作用
上皮细胞SHP2在分娩启动过程中发挥关键作用

1.上皮细胞在分娩启动过程中合成PGF2a

2.上皮细胞SHP2调控PGF2a的合成

分娩过程中的细胞异质性的改变
分娩过程中的细胞异质性的改变

利用单细胞测序揭示分娩前母体细胞异质性的改变,同时描绘不同细胞间互作在流产过程潜在的功能

内皮细胞在分娩过程中的功能
内皮细胞在分娩过程中的功能

内皮细胞中的TLR4在炎症诱导早产的过程中发挥着必不可少的作用

胚胎植入过程中全子宫三维成像
胚胎植入过程中全子宫三维成像

内皮细胞中的TLR4在炎症诱导早产的过程中发挥着必不可少的作用

反复流产中细胞异质性的改变
反复流产中细胞异质性的改变

利用单细胞测序揭示孕早期母体细胞异质性的改变,同时描绘不同细胞间互作在流产过程潜在的功能

蜕膜早衰在早产过程中的功能
蜕膜早衰在早产过程中的功能

p53缺失可导致蜕膜早产

课题组成员

博士后

徐迎春

徐迎春

博士后

2012.9 - 2017.7 新乡医学院三全学院 本科

2017.9 - 2020.7 厦门大学 硕士

2020.9 - 2024.7 厦门大学 博士

2024.8 - 至今 厦门大学 博士后

刘萌

刘萌

博士后

2015.9 - 2019.6 武汉科技大学 本科

2019.9 - 2025.6 厦门大学 硕博连读

2025.09 - 至今 厦门大学 博士后

徐泽平

徐泽平

博士后

2014.9 - 2018.6 湖北大学 本科

2018.9 - 2025.12 厦门大学 硕博连读

2025.12 - 至今 厦门大学 博士后

在读博士

王旸

王旸

博士研究生

2015.9 - 2019.6 郑州师范学院 本科

2019.9 - 2021.7 厦门大学 硕士

2021.9 - 至今 厦门大学 博士

史昊然

史昊然

博士研究生

2014.9 - 2019.6 三峡大学 本科

2019.9 - 2022.6 华中科技大学 硕士

2022.9 - 至今 厦门大学 博士

纪艺珍

纪艺珍

博士研究生

2009.9 - 2014.6 南方医科大学 本科

2014.9 - 2017.6 上海交通大学 硕士

2024.9 - 至今 厦门大学 博士

王梦媛

王梦媛

博士研究生

2015.9 - 2019.9 河南农业大学 本科

2020.9 - 2023.6 东北农业大学 硕士

2023.9 - 至今 厦门大学 博士

孙亚

孙亚

博士研究生

2016.9 - 2020.6 潍坊理工学院 本科

2020.9 - 2023.6 东北农业大学 硕士

2023.9 - 至今 厦门大学 博士

张蕾蕾

张蕾蕾

博士研究生

2017.9 - 2021.7 哈尔滨医科大学 本科

2022.9 - 至今 厦门大学 硕博连读

司品欣

司品欣

博士研究生

2016.9 - 2021.6 济宁医学院 本科

2021.9 - 2024.7 山东大学 硕士

2024.9 - 至今 厦门大学 博士

李领航

李领航

博士研究生

2017.9 - 2021.7 沈阳农业大学 本科

2022.9 - 2024.7 厦门大学 硕士

2024.9 - 至今 厦门大学 博士

郑子彦

郑子彦

博士研究生

2018.9 - 2022.6 浙江万里学院 本科

2023.9 - 至今 厦门大学 硕博连读

李思特

李思特

博士研究生

2019.9 - 2023.6 湖南中医药大学 本科

2023.9 - 至今 厦门大学 硕博连读

赵境伟

赵境伟

博士研究生

2017.9 - 2020.6 武汉城市职业学院 专科

2020.9 - 2022.6 江汉大学 本科

2022.9 - 2025.6 武汉科技大学 硕士

2025.9 - 至今 厦门大学 博士

余兆威

余兆威

博士研究生

2019.9 - 2022.6 江西中医药大学 本科

2022.9 - 2025.6 山西医科大学 硕士

2025.9 - 至今 厦门大学 博士

李杭

李杭

博士研究生

2017.9 - 2021.6 广西师范大学 本科

2023.9 - 至今 厦门大学 硕博连读

陈璐

陈璐

博士研究生

2014.9 - 2019.6 江苏大学 本科

2019.9 - 2022.6 江苏大学 硕士

2025.9 - 至今 福建医科大学/厦门大学 博士

在读硕士

洪叶涛

洪叶涛

硕士研究生

2020.9 - 2023.7 安徽农业大学 本科

2023.9 - 至今 厦门大学 硕士

熊文渊

熊文渊

硕士研究生

2019.9 - 2023.6 福建农林大学 本科

2024.9 - 至今 厦门大学 硕士

贾莹莹

贾莹莹

硕士研究生

2018.9 - 2022.06 济宁医学院 本科

2024.9 - 至今 厦门大学 硕士

程芳媛

程芳媛

硕士研究生

2020.9 - 2024.6 湖北中医药大学 本科

2024.9 - 至今 厦门大学 硕士

陈曦

陈曦

硕士研究生

2021.9 - 2025.6 东北林业大学 本科

2025.9 - 至今 厦门大学 硕士

杜宗洛

杜宗洛

硕士研究生

2020.9 - 2024.6 曲阜师范大学 本科

2025.9 - 至今 厦门大学 硕士

周耀鑫

周耀鑫

硕士研究生

2020.9 - 2025.6 哈尔滨医科大学 本科

2025.9 - 至今 厦门大学 硕士

已毕业学生

刘钊

刘钊

已毕业

2008.9 - 2013.6 华北理工大学 本科

2013.9 - 2016.6 华北理工大学 硕士

2018.9 - 2021.6 华北理工大学/厦门大学 博士

赵慧

赵慧

已毕业

2012.9 - 2016.6 山东农业大学 本科

2016.9 - 2019.6 西北农林科技大学 硕士

2019.9 - 2023.6 厦门大学 博士

许辉

许辉

已毕业

2015.9 - 2019.6 安徽师范大学 本科

2019.9 - 2022.6 厦门大学 硕士

徐新眉

徐新眉

已毕业

2016.9 - 2020.6 厦门大学 本科

2020.9 - 2023.6 厦门大学 硕士

朱思静

朱思静

已毕业

2017.9 - 2021.6 陕西师范大学 本科

2021.9 - 2024.6 厦门大学 硕士